Logiciel de gestion de paie : top des meilleurs logiciels en 2025

Vos ressources humaines vous le diront : rien de plus chronophage que les tâches administratives en entreprise ! Remplir des fiches de paie et de longs tableaux Excel demande du temps et beaucoup de minutie. Même dans un service très organisé, on n’est jamais à l’abri d’une double saisie ou d’une perte de feuille de présence. Pour éviter ça, une seule solution : un logiciel de gestion de paie.

Cet outil 100 % digital centralise vos données RH sur une seule et même plateforme. Finies les erreurs : vous obtenez des bulletins de paie et les déclarations sociales dans le format qui vous va bien, en quelques clics seulement. Avec un logiciel de gestion de paie, vous gagnez du temps, réduisez vos coûts et restez en conformité vis-à-vis de la réglementation ! 

Au-delà de connaître les avantages des logiciels de gestion, il est important de pouvoir être en mesure de choisir un outil correspondant précisément aux besoins de votre entreprise : il existe en effet aujourd’hui de nombreux types de logiciels, et certains possèdent des fonctionnalités et une interface qui seront plus adaptées à vos objectifs que d’autres. Vous souhaitez savoir comment faire pour choisir le meilleur logiciel de gestion de paie ? Suivez le guide, Combo est là pour vous aider !

Qu’est-ce qu’un logiciel de gestion de paie ?

Les logiciels de gestion de paie sont des outils informatiques qui automatisent les processus liés à la gestion de la paie et des salaires que chaque entreprise est tenue de prendre en charge. Généralement, c’est le service des ressources humaines qui encadre ce type de logiciel (DRH, Manager…). Avec ces solutions digitales, le gestionnaire en charge de la paie n’a plus qu’à saisir les données relatives aux salariés pour générer automatiquement des bulletins de salaire ainsi que toutes les déclarations conformes à la législation sociale et à la situation personnelle des employés, depuis l’embauche jusqu’au départ.

Deux grandes catégories de logiciels disponibles sur le marché 

En termes d’installation, il existe deux types de logiciels de gestion de paie :

• On-Premise : le logiciel s’installe directement sur le serveur de l’entreprise, auquel cas l’employeur acquiert une licence auprès de l’éditeur ; l’outil est alors téléchargé ou installé sur le serveur via un support physique, ce qui signifie que l’ordinateur doit posséder un espace de stockage suffisant pour prendre en charge l’installation. 
• SaaS (solution en ligne) : avec cette solution, le logiciel est installé sur les serveurs de l’hébergeur (et non les serveurs des entreprises). Il est donc accessible à distance depuis un navigateur web ou une application mobile, auquel cas l’entreprise paie un abonnement.

Vous choisirez l’un des deux modèles en fonction des spécificités et des besoins de votre structure.

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Quels sont les avantages d’un logiciel de gestion de paie ?

TPE, PME, grande groupe…Les logiciels de gestion de paie présentent des avantages pour tous types d’entreprises. Quels que soient votre taille et votre secteur d’activité, le traitement de la paie prend du temps et doit répondre à des règles légales et contractuelles. Vous ne pouvez pas vous permettre de vous tromper dans vos déclarations ni de prendre du retard sur l’envoi des bulletins de paie.

Les principaux avantages des SIRH dédiés à la paie sont :

• Un gain de temps phénoménal : la première raison d’utiliser un logiciel de gestion est l’optimisation des processus RH grâce à l’automatisation des tâches répétitives et chronophages (matricule fiche de paie…) permise par le logiciel;
• Une réduction des coûts : en utilisant un logiciel pour la gestion des salaires, vos services de ressources humaines possèdent beaucoup plus de temps pour se concentrer sur les employés et prendre en charge des missions à plus forte valeur ajoutée ;
• Une réduction des risques d’erreurs humaines : grâce à la sécurisation et à la centralisation de toutes les données RH (dont les salaires et à la paie, bien sûr), mais aussi aux calculs des variables automatisés, vous réduisez considérablement les risques d’erreurs.  
• Une paie conforme : votre logiciel de gestion de paie peut être en mesure de réaliser une veille réglementaire et juridique pour votre entreprise ;
• Un contrôle des données RH : si vous utilisez un logiciel de gestion, vous n’avez pas besoin d’externaliser ! Vous gardez en effet la main sur vos processus RH plutôt que de rechercher une assistance via à une entreprise tierce. Les logiciels proposent par ailleurs très souvent des outils de reporting et d'export.
• La possibilité d’automatiser les processus liés à la gestion des congés et des absences des employés : qui dit gestion de la paie dit gestion des congés et des absences ! C’est pourquoi de nombreux logiciels vous permettent d’importer vos solutions dédiées aux congés payés et aux absences des salariés, ou proposent ces fonctionnalités au sein de l’interface. 

Quelles sont les fonctionnalités d’un logiciel de paie ?

Il est avant tout important de le souligner : les logiciels de paie ne disposent pas tous des mêmes fonctionnalités. Certains sont en effet plus complets que d’autres. Au moment de faire votre choix, tout devra donc dépendre des besoins de votre entreprise en matière de modules, mais aussi, bien sûr, du prix de l’abonnement ou de la licence demandée pour exploiter le logiciel. Voici les fonctionnalités principales d’un logiciel de gestion de paie :

Les grandes fonctionnalités des logiciels de gestion de paie

Quel logiciel de gestion de paie choisir pour son entreprise ? Voici les fonctionnalités principales à retenir :

• Calcul de la paie ;
• Calcul des charges sociales et impôts ;
• Édition et archivage du bulletin de salaire dématérialisé ;
• Déclarations sociales administratives (DSN) ;
• Réalisation des documents administratifs RH (contrat de travail, arrêt de travail…) ;
• Gestion de l’épargne salariale ;
• Tenue d’un registre du personnel ;
• Outils de reporting et contrôle de la paie.

D’autres fonctionnalités peuvent être proposées par les logiciels de paie. Veillez donc à bien vous renseigner sur les modules des différentes solutions qui vous intéressent pour votre entreprise avant de faire votre choix.  

Gestion de la paie : comment choisir un logiciel adapté à son activité ?

Vous souhaitez utiliser le meilleur logiciel de gestion de paie du marché ? C’est logique, bien sûr, puisque vous voulez assurément ce qui se fait de mieux pour votre entreprise. Mais avant de consulter la liste des solutions les plus citées dans les avis des experts, n’oubliez pas que le plus important est de trouver un logiciel dont le fonctionnement et les services correspondront avant tout aux besoins de votre activité. En d’autres termes, vous devez réussir à obtenir le meilleur outil pour VOTRE entreprise et la gestion des salaires de vos employés. 

Les bonnes questions à se poser dans le choix du logiciel de paie

Pour faire le bon choix, commencez par vous poser un certain nombre de questions. Ces questionnements vous permettront de mieux cerner vos besoins, ce qui vous aidera par la suite à choisir un logiciel dont les fonctionnalités seront capables d’y répondre avec précision. 

• Quelle est la taille et la nature de mon entreprise ? TPE, PME, grande structure, franchisé…Comme mentionné plus haut, les différentes solutions de gestion de la paie disponibles ne sont pas toutes identiques. Selon les fonctionnalités proposées, mais aussi le fonctionnement global de l’outil, certains logiciels seront plus appropriés pour les TPE ou les PME, par exemple, tandis que d’autres répondront mieux aux exigences des grandes entreprises. 
• Quel est le budget dont mon entreprise dispose ? Il s’agit bien sûr de l’un des premiers critères à prendre en compte. Comme nous l’avons précisé, selon la solution privilégiée (SaaS ou logiciel On-Promise) et l’outil, le prix ne sera pas le même. En connaissant votre budget, vous pourrez donc rapidement vous orienter vers les solutions les plus adaptées. 
• Quels sont mes besoins en matière de gestion de la paie et des salaires ? Calcul des salaires, édition des fiches de paie, mise en conformité des documents relatifs à la paie, centralisation des documents et informations RH, calcul automatique des charges sociales et des impôts, déclarations sociales administratives (DSN)…Connaître précisément vos exigences est indispensable pour réussir à choisir un logiciel dont les fonctionnalités pourront y répondre de manière précise.
•  Quels seront les utilisateurs du logiciel au quotidien ? Le nombre de personnes amenées à utiliser le logiciel (employés, manager, DRH…) doit également orienter votre choix – si votre logiciel permet aussi à vos salariés de gérer eux-mêmes leurs demandes de congés et leurs absences, il est judicieux d’opter pour une solution simple et intuitive facile à prendre en main. 
•  Est-ce que j’ai besoin d’un logiciel de paie spécifique ou d’une solution multifonction plus globale ? Certains logiciels ne proposent qu’un module dédié à la gestion de la paie et des salaires, d’autres disposent d’une solution plus complète capable de prendre en charge plusieurs autres opérations RH (comme la gestion des congés  et des absences, par exemple). 

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Faire la distinction entre logiciel de paie et logiciel de préparation de paie

Autre point indispensable à connaître avant de faire son choix : il est important de bien distinguer les logiciels de paie spécifiques, qui vont posséder leur propre interface dédiée à la gestion de la paie et des salaires, et les logiciels RH tout-en-un (à l’image de Combo, par exemple) qui vous permettent, quant à eux, de vous connecter à des logiciels de paie en ligne ou des solutions d’experts-comptables.  

💡 Le conseil du blog Combo : nos experts vous recommandent de miser sur un outil qui permet d’exporter facilement vos éléments variables à votre expert-comptable, et qui soit capable de s’interfacer avec d’autres logiciels de gestion des ressources humaines (GRH), comme des solutions de comptabilité ou de gestion du personnel. Cette modulation vous permettra de personnaliser l’outil afin qu’il corresponde véritablement à votre organisation, et de le faire évoluer avec vous. Vous suivez également tous les indicateurs de performance RH importants pour suivre l’activité des ressources humaines.

Quel est le meilleur logiciel de gestion de paie ?

Vous avez besoin d’aide pour choisir votre logiciel ? Quelles fonctionnalités privilégier selon votre structure ? Voici notre top 9 des logiciels de paie et logiciels de préparation de paie !

Combo, la solution de gestion des temps pour une préparation de la paie simplifiée

Pour une gestion des salariés de A à Z, choisissez Combo. Véritable assistant de préparation de la paie, il compile tous les éléments variables et exporte vos documents RH au format souhaité, dans le respect de la réglementation en vigueur. Il propose des périodes de paie personnalisées pour manager tous vos salariés, intérimaires, stagiaires et extras.

Cette solution offre également une gestion du planning du personnel afin de connecter vos feuilles de présence et votre pointeuse digitale au système de paie. Il permet aussi de créer et de rassembler tous vos documents des ressources humaines importants, comme les contrats de travail, les bulletins de paie, les fiches de fonction, les registres du CSE… De plus, Combo intègre de nombreux autres logiciels RH comme Payfit ou des experts comptables, afin de fournir plus de fonctionnalités à votre entreprise.

Payfit, le logiciel de paie pour PME

Avec Payfit, vous simplifiez vos processus de paie et de déclarations sociales. Vos bulletins de salaire sont automatisés et vos charges sociales sont calculées en un rien de temps. Ce logiciel de gestion pour PME vous promet une maîtrise parfaite de votre paie, rapide et sans erreur.

👉 En savoir plus sur Payfit

Sage Business Cloud, la compta des petites entreprises

Solution de comptabilité et de facturation, ce logiciel de gestion de paie en ligne automatise vos processus RH en générant vos fiches de salaire et en télédéclarant vos charges sociales obligatoires. Il faut également noter une assistance technique en ligne, par mail, chat ou téléphone, pour vous accompagner chez Sage Business Cloud.

MaCompta.fr, la gestion de la paie à petit prix

Avec MaCompta.fr, tout se fait en ligne. Cette solution s’adapte à votre activité professionnelle et à votre niveau de compétences en comptabilité, ajustant le prix du logiciel. Elle s’adresse aussi aux freelances et aux associations. Via un abonnement, vous créez vos documents RH de manière fiable et sécurisée sur votre compte, comme des fiches de paie pour HCR ou pour votre boutique.

Pagga, la distribution de la paie

Service de la société Lucca, l’application Pagga distribue vos bulletins de paie dématérialisés à l’ensemble de vos salariés, en moins de 5 minutes. Une solution simple et efficace, avec diverses fonctionnalités RH qui vous permet de gagner du temps au quotidien.

ADP, le logiciel de gestion pour les petites et grandes entreprises

Contrairement à la plupart des logiciels de gestion de paie présentés ci-dessus, ADP s’adresse à toute taille d’entreprise. Cet outil permet également de gérer des comptes multi-sites, aux quatre coins du monde, avec des mises à jour fréquentes et une assistance technique ultra réactive.

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Cegid, un logiciel de gestion tout-en-un destiné aux PME

Cegid figure régulièrement dans les listes des meilleurs logiciels de gestion pour les petites et moyennes entreprises. Concernant la gestion de la paie de vos employés, le logiciel vous propose plusieurs fonctionnalités capables de couvrir l’ensemble de vos besoins : paie et gestion d’activité, dématérialisation des fiches de paie, épargne salariale, tableau de bord RH et pilotage social, masse salariale…En plus de ces fonctionnalités, Cegid peut vous assister dans de nombreux autres domaines pour la gestion des ressources humaines : comptabilité, finance et fiscalité, Rh, gestion commerciale et d’affaires, reporting RH…

En plus de ces fonctionnalités, Cegid peut vous assister dans de nombreux autres domaines : comptabilité, finance et fiscalité, Rh, gestion commerciale et d’affaires, reporting…  

Listo Paye, une solution 100 % en ligne

Comme les autres logiciels de notre classement, Listo Paye vous permet d’automatiser efficacement la production de votre paie. Au fonctionnement simple et efficace, cette solution digitale vous permet notamment de créer en quelques clics des fiches de paie complètes et réglementaires que vous pourrez transmettre à vos salariés au format PDF. 

Le logiciel est également idéal pour centraliser tous les documents Rh dont le service des ressources humaines a besoin pour la gestion de la paie au quotidien. Parmi les nombreuses fonctionnalités proposées, on retrouve le calcul et la collecte du prélèvement de l’impôt à la source, le calcul automatique de la paie ou la génération automatique des déclarations sociales obligatoires (DSN). 

Nibélis, la solution RH 100 % cloud pour PME et ETI

Le logiciel Nibélis vous propose des fonctionnalités capables de couvrir tous vos processus de paie ainsi que l’ensemble des démarches RH de votre entreprise. Intuitive et simple à prendre en main, l’interface de cette solution disponible en ligne répond autant aux exigences des PME que des ETI (entreprises de taille intermédiaire).

Les fonctionnalités proposées pour la gestion de la paie : édition de fiches de paie 100 % conformes, automatisation des traitements des salaires (audit des bulletins, import des variables de paie, télétransmission des DSN)… 

Top des logiciels de gestion de paie : le tableau comparatif

Besoin de comparer les logiciels de gestion de paie entre eux pour choisir celui qui convient le mieux à votre entreprise ? Entreprise ciblée, offre, fonctionnalités, note… On vous résume tout dans ce tableau comparatif !

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